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PPGZT-CCA039 - ANÁLISE DE DADOS GENÔMICOS NO MELHORAMENTO ANIMAL - Turma: 01 (2022.2)

Tópicos Aulas
Sequenciamento (20/10/2022 - 20/10/2022)
Fundamentos da Genome Wide Selection (GWS) (01/11/2022 - 01/11/2022)
   Livro - GWS via REML/BLUP 
Discussão e apresentação de artigos relacionados (03/11/2022 - 03/11/2022)
Métodos Estatísticos na Genome Wide Selection (GWS) (08/11/2022 - 08/11/2022)
Discussão e apresentação de artigos relacionados (10/11/2022 - 10/11/2022)
Fundamentos da Genome Wide Association Studies (GWAS) (15/11/2022 - 15/11/2022)
Discussão e apresentação de artigos relacionados (17/11/2022 - 17/11/2022)
G-BLUP Single Step (22/11/2022 - 22/11/2022)
  Artigo para discussão na aula de 13/12 
Leiam o artigo para discutirmos na aula de terça-feira
Discussão e apresentação de artigos relacionados (24/11/2022 - 24/11/2022)
Utilização de softwares para análise genômica (29/11/2022 - 29/11/2022)
  Mapa 
Discussão e apresentação de artigos relacionados (01/12/2022 - 01/12/2022)
Interpretação de resultados (06/12/2022 - 06/12/2022)
Discussão e apresentação de artigos relacionados (08/12/2022 - 08/12/2022)
Avaliação da Disciplina (15/12/2022 - 15/12/2022)
Frequências da Turma
# Matrícula OUT NOV DEZ Total
20 25 27 01 03 08 10 17 22 24 06 13 15
1 2021101**** 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2 2021101**** 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Notas da Turma
# Matrícula Unid. 1 Unid. 2 Unid. 3 Prova Final Resultado Faltas Situação
1 2021101**** 9,5 9,8 10,0 9.8 0 AM
2 2021101**** 9,5 9,8 10,0 9.8 0 AM

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Plano de Curso

Nesta página é possível visualizar o plano de curso definido pelo docente para esta turma.

Dados da Disciplina
Ementa: Fundamentos da GenomeWideSelection (GWS). Métodos Estatísticos na seleção genômica ampla. G-BLUP Single Step. Utilização de softwares para análise genômica. Interpretação de resultados.
Objetivos:
Metodologia de Ensino e Avaliação
Metodologia: Aula teórica - dialogada, explicativa e expositiva dos assuntos.
Aula prática - aplicação dos conhecimentos teóricos no uso de softwares para avaliação animal.
Procedimentos de Avaliação da Aprendizagem: Serão realizadas duas atividades em grupo e individual, estas servirão como base para avaliação do ensino-aprendizado do(a) doutorando(a).
Horário de atendimento: Quarta-feira e Sexta-feira => das 14:00 às 18:00
Bibliografia: BIBLIOGRAFIA BÁSICA:

GONDRO, C.; van der WERF, J.; HAYES, B. Genome-Wide Association Studies and Genomic Prediction. New York: Springer, 2013.

HENDERSON, C. R. Application of linear models in animal breeding. Ghelph, 1984. 385p.

ISIK, F.; HOLLAND, J.; MALTECCA, C. Genetic data analysis for plant and animal breeding. North Carolina State: Releigh, 2017. 510 p.

KHATIB, H. Molecular and Quantitative Animal Genetics, Madson: WILEY Blackwell, 2015. 331p.

RESENDE , M. D. V.; SILVA, F. F..; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos, generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão aleatória, seleção genômica, QTL-GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: Suprema, 2014.

RESENDE, M. D. V.; SILVA, F. F.; VIANA, J. M. S.; PETERNELLI, L. A.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; MUÑOZ del VALLE, P. Métodos estatísticos na seleção genômica ampla. Colombo: Embrapa Florestas, 2011.

RESENDE, M. D. V.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; AGUIAR, A. M.; ABAD, J. I. M.; MISSIAGGIA, A. A.; SANSALONI, C.; PETROLI, C.; GRATTAPAGLIA, D. Computação da Seleção Genômica Ampla. Colombo: Embrapa Florestas, 2010.

BIBLIOGRAFIA COMPLEMENTAR:

ANDRESON, L.; GEORGES, M.; Domestic animalgenomes: deciphering the genetics of complex traits. Nature Reviews Genetics, v. 5, n. 3, p. 202-212, 2004.

GODDARD, M. E.; HAYES, B. J.; MEUWISSEN, T. H. E. Using the genomic relationship matrix to predict the acuracy of genomic selection. Joural of Animal Breeding and Genetics, v. 128, n. 6, p. 409-421, 2011.

MEUWISSEN, T. H. E. Genomic Selection: marker assisted selection on genome-wide scale. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 124, p. 53, 2009.
Cronograma de Aulas

Início

Fim

Descrição
20/10/2022
20/10/2022
Sequenciamento
01/11/2022
01/11/2022
Fundamentos da Genome Wide Selection (GWS)
03/11/2022
03/11/2022
Discussão e apresentação de artigos relacionados
08/11/2022
08/11/2022
Métodos Estatísticos na Genome Wide Selection (GWS)
10/11/2022
10/11/2022
Discussão e apresentação de artigos relacionados
15/11/2022
15/11/2022
Fundamentos da Genome Wide Association Studies (GWAS)
17/11/2022
17/11/2022
Discussão e apresentação de artigos relacionados
22/11/2022
22/11/2022
G-BLUP Single Step
24/11/2022
24/11/2022
Discussão e apresentação de artigos relacionados
29/11/2022
29/11/2022
Utilização de softwares para análise genômica
01/12/2022
01/12/2022
Discussão e apresentação de artigos relacionados
06/12/2022
06/12/2022
Interpretação de resultados
08/12/2022
08/12/2022
Discussão e apresentação de artigos relacionados
15/12/2022
15/12/2022
Avaliação da Disciplina
Avaliações
Data Descrição
01/12/2022 1ª Avaliação
08/12/2022 2ª Avaliação
15/12/2022 3ª Avaliação
: Referência consta na biblioteca
Referências Básicas
Tipo de material Descrição
Referências Complementares
Tipo de material Descrição
Notícias da Turma
: Visualizar

Título

Data
Aula 06/12/2022 05/12/2022

SIGAA | Superintendência de Tecnologia da Informação - STI/UFPI - (86) 3215-1124 | sigjb03.ufpi.br.sigaa vSIGAA_3.12.1104 01/09/2024 03:36