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Banca de DEFESA: FRANCISCO DE ASSIS DINIZ SOBRINHO

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: FRANCISCO DE ASSIS DINIZ SOBRINHO
DATA: 20/08/2024
HORA: 15:00
LOCAL: online google meet
TÍTULO: Hotspots de adaptação revelados pela genômica e risco de desaparecimento nas populações caprinas brasileiras
PALAVRAS-CHAVES: Genética da evolução, alvos de seleção, cabra hircus
PÁGINAS: 88
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Zootecnia
SUBÁREA: Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
RESUMO:
Acessamos um conjunto de dados de genótipos 50K Illumina SNP de duas importantes raças caprinas do semiárido brasileiro para analisar a abundância e duração de corridas de homozigosidade (ROH). Esta análise visa elucidar a importância da história de adaptação no genoma das populações caprinas brasileiras e mensurar a endogamia genômica. Regiões ricas em heterozigosidade (HRR) ou regiões genômicas de alta variabilidade genética fornecem pistas sobre como a diversidade pode estar associada ao aumento da aptidão, evitando alelos homozigotos deletérios. No geral, foram identificadas 22.872 ROH. O número médio de ROH por indivíduo variou de 74,73 (raça comercial Anglo-Nubiana) a 173,85 (raça crioula Marota). A análise da distribuição das corridas de homozigose de acordo com o tamanho mostrou que, para ambas as raças, a maioria dos ROH estava na categoria curta (<2,0 Mb) (65,6%). A endogamia baseada em ROH (FROH) revelou níveis baixos em Anglo-Nubianos (0,0627) e altos níveis em Marota (0,1419), provavelmente devido a uma redução no tamanho efetivo da população ao longo de gerações na raça tradicional Marota. Definimos ilhas de ROH e HRR e identificamos regiões comuns na cabra Marota, onde estão localizados genes a SNP de duas importantes raças caprinas do semiárido brasileiro para analisar a abundância e duração de corridas de homozigosidade (ROH). Esta análise visa elucidar a importância da história de adaptação no genoma das populações caprinas brasileiras e mensurar a endogamia genômica. Regiões ricas em heterozigosidade (HRR) ou regiões genômicas de alta variabilidade genética fornecem pistas sobre como a diversidade pode estar associada ao aumento da aptidão, evitando alelos homozigotos deletérios. No geral, foram identificadas 22.872 ROH. O número médio de ROH por indivíduo variou de 74,73 (raça comercial Anglo-Nubiana) a 173,85 (raça crioula Marota). A análise da distribuição das corridas de homozigose de acordo com o tamanho mostrou que, para ambas as raças, a maioria dos ROH estava na categoria curta (<2,0 Mb) (65,6%). A endogamia baseada em ROH (FROH) revelou níveis baixos em Anglo-Nubianos (0,0627) e altos níveis em Marota (0,1419), provavelmente devido a uma redução no tamanho efetivo da população ao longo de gerações na raça tradicional Marota. Definimos ilhas de ROH e HRR e identificamos regiões comuns na cabra Marota, onde estão localizados genes relacionados a diversas características, como desenvolvimento embrionário, crescimento corporal, homeostase lipídica e funções cerebrais. Estes resultados indicam que tais regiões estão associadas a muitas características e, portanto, têm sofrido pressão seletiva nessas raças caprinas criadas diferentes fins. características, como desenvolvimento embrionário, crescimento corporal, homeostase lipídica e funções cerebrais. Estes resultados indicam que tais regiões estão associadas a muitas características e, portanto, têm sofrido pressão seletiva nessas raças caprinas criadas para diferentes fins.

 


MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 012.068.217-60 - ADRIANA MELLO DE ARAÚJO - EMBRAPA
Interno - 446.200.203-20 - DANIELLE MARIA MACHADO RIBEIRO AZEVEDO - EMBRAPA
Interno - 1737174 - FABIO BARROS BRITTO
Externo ao Programa - 341.801.208-60 - MIKLOS MAXIMILIANO BAJAY - USP
Externo à Instituição - JEANE DE OLIVEIRA MOURA - IFPI
Externo à Instituição - LEONARDO CASTELO BRANCO CARVALHO - UFRA
Notícia cadastrada em: 09/08/2024 15:38
SIGAA | Superintendência de Tecnologia da Informação - STI/UFPI - (86) 3215-1124 | © UFRN | sigjb05.ufpi.br.instancia1 07/12/2024 18:38