ASSOCIAÇÃO E SELEÇÃO GENOMICA AMPLA EM OVINOS SANTA INES PARA CARACTERISTICAS RELACIONADAS A RESISTÊNCIA A ENDOPARASITAS
Acurácia de predição, GWAS, GWS, marcadores SNP, métodos bayesianos, predição de valores genômicos
Estudos de assocociação e seleção genômica ampla no melhoramento genético de ovinos vêm sendo executados com o objetivo de promover melhorias na produção e seleção de animais. O objetivo com esta pesquisa foi identificar marcadores SNPs associados a fenótipos de resistência à parasitose em ovinos Santa Inês, para posteriormente realizar levantamento de genes relacionados às características nos diversos cromossomos, além de encontrar o melhor modelo de seleção genômica e aplicá-lo. Foram utilizados dados de 271 ovinos criados nos estados do Piauí e Maranhão com registro na Associação Brasileira de Criadores de Ovinos. A genotipagem foi realizada com o SNP Chip Ovine da Illumina, de modo que após aplicação de critérios de qualidade, foram utilizados 44.580 SNPs para as análises genômicas. A análise de associação genômica ampla foi realizada pelo método de regressão corrigido para efeitos aleatórios poligênicos e após encontrar marcadores significativos foi realizada busca no NCBI para verificar a existência de genes descritos relacionados com a característica associada. Com os resultados da GWAS verificou-se que os cromossomos 8 e 12 apresentaram marcadores significativos para a característica presença de ovos de Strongylus e nos cromossomos 2 e 6 marcadores significativos para OPG. Verificou-se também, no cromossomo 2, marcador associado a característica escore da condição corporal e no cromossomo 21 marcadores associados a característica presença de pelo arrepiado. No que refere-se a seleção genômica foram testados cinco modelos bayesianos para estimação dos efeitos dos marcadores para as características relacionadas a resistência à parasitose: Modelo Bayesian Ride Regression (BRR) através de regressão aleatória, Bayes A, Bayes B, Bayes C e Bayesian Least Absolut Shrinkage and Selection Operator (BLASSO). Para definição do melhor modelo foi analisada a acurácia do valor genético genômico. Os métodos Bayesianos testados proporcionaram maior acurácia de predição quando comparados a predição obtida pelo método tradicional utilizando a matriz de parentesco calcualdo pela relação média de parentesco. O modelo BRR foi escolhido como melhor modelo por possuir menos parâmetros a serem estimados e proporcionar acurácia de predição dos valores genômicos semelhante aos demais modelos estudados.