Notícias

Banca de DEFESA: DANIEL BIAGIOTTI

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: DANIEL BIAGIOTTI
DATA: 07/03/2016
HORA: 08:00
LOCAL: Auditório do Núcleo de Pós-Graduação em Ciências Agrárias
TÍTULO:

ASSOCIAÇÃO E SELEÇÃO GENOMICA AMPLA EM OVINOS SANTA INES PARA CARACTERISTICAS RELACIONADAS A RESISTÊNCIA A ENDOPARASITAS


PALAVRAS-CHAVES:

Acurácia de predição, GWAS, GWS, marcadores SNP, métodos bayesianos, predição de valores genômicos


PÁGINAS: 73
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Zootecnia
SUBÁREA: Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
RESUMO:

Estudos de assocociação e seleção genômica ampla no melhoramento genético de ovinos vêm sendo executados com o objetivo de promover melhorias na produção e seleção de animais. O objetivo com esta pesquisa foi identificar marcadores SNPs associados a fenótipos de resistência à parasitose em ovinos Santa Inês, para posteriormente realizar levantamento de genes relacionados às características nos diversos cromossomos, além de encontrar o melhor modelo de seleção genômica e aplicá-lo. Foram utilizados dados de 271 ovinos criados nos estados do Piauí e Maranhão com registro na Associação Brasileira de Criadores de Ovinos. A genotipagem foi realizada com o SNP Chip Ovine da Illumina, de modo que após aplicação de critérios de qualidade, foram utilizados 44.580 SNPs para as análises genômicas. A análise de associação genômica ampla foi realizada pelo método de regressão corrigido para efeitos aleatórios poligênicos e após encontrar marcadores significativos foi realizada busca no NCBI para verificar a existência de genes descritos relacionados com a característica associada. Com os resultados da GWAS verificou-se que os cromossomos 8 e 12 apresentaram marcadores significativos para a característica presença de ovos de Strongylus e nos cromossomos 2 e 6 marcadores significativos para OPG. Verificou-se também, no cromossomo 2, marcador associado a característica escore da condição corporal e no cromossomo 21 marcadores associados a característica presença de pelo arrepiado. No que refere-se a seleção genômica foram testados cinco modelos bayesianos para estimação dos efeitos dos marcadores para as características relacionadas a resistência à parasitose: Modelo Bayesian Ride Regression (BRR) através de regressão aleatória, Bayes A, Bayes B, Bayes C e Bayesian Least Absolut Shrinkage and Selection Operator (BLASSO). Para definição do melhor modelo foi analisada a acurácia do valor genético genômico.  Os métodos Bayesianos testados proporcionaram maior acurácia de predição quando comparados a predição obtida pelo método tradicional utilizando a matriz de parentesco calcualdo pela relação média de parentesco. O modelo BRR foi escolhido como melhor modelo por possuir menos parâmetros a serem estimados e proporcionar acurácia de predição dos valores genômicos semelhante aos demais modelos estudados.


MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - ANTONIO DE SOUSA JUNIOR - UFPI
Externo à Instituição - FABYANO FONSECA E SILVA - UFV
Presidente - 1550485 - JOSE LINDENBERG ROCHA SARMENTO
Externo à Instituição - KATIENE REGIA SILVA SOUSA - UFMA
Externo ao Programa - 2872864 - MARCIO DA SILVA COSTA
Notícia cadastrada em: 19/02/2016 08:34
SIGAA | Superintendência de Tecnologia da Informação - STI/UFPI - (86) 3215-1124 | © UFRN | sigjb03.ufpi.br.sigaa 17/06/2024 22:44