A doença de chagas permanece como importante problema de saúde pública, e as limitações associadas ao tratamento disponível reforçam a necessidade de investigação de novas moléculas com potencial terapêutico. Neste estudo, avaliou-se, por abordagens in silico, o potencial inibitório de alcaloides de Catharanthus roseus frente à cruzaína, tripanotiona redutase e trans-sialidase de Trypanosoma cruzi. Inicialmente, 19 alcaloides foram submetidos à ancoragem molecular, sendo reserpine, strictosidine e vinblastine selecionados para análises posteriores por apresentarem, de forma recorrente, elevada afinidade predita frente aos três alvos. A estabilidade e o comportamento conformacional dos nove complexos selecionados foram investigados por simulações de dinâmica molecular de 100 ns, considerando parâmetros estruturais e de interação proteína–ligante. Os resultados evidenciaram comportamentos dependentes do alvo. A strictosidine apresentou o perfil global mais consistente, mantendo características compatíveis com a proximidade aos ambientes catalíticos das três enzimas. A reserpine demonstrou comportamento particularmente favorável nos complexos com cruzaína e tripanotiona redutase, enquanto sua relocalização na trans-sialidase reduziu a sustentação de uma possível inibição diretamente associada ao ambiente catalítico. A vinblastine apresentou comportamento favorável sobretudo frente à tripanotiona redutase e à trans-sialidase, ao passo que, na cruzaína, seu afastamento dos resíduos catalíticos tornou menos consistente a hipótese de inibição direta desse alvo. A caracterização por Teoria do Funcional da Densidade revelou diferenças nas propriedades eletrônicas e na reatividade dos três alcaloides, complementando a compreensão de suas características moleculares. As predições pelo PASS indicaram atividades biológicas de interesse, com destaque para o perfil antiprotozoário associado à reserpine e à strictosidine, enquanto a vinblastine apresentou atividades predominantemente relacionadas à tubulina e aos microtúbulos. As análises ADMET complementaram a caracterização dos compostos, evidenciando propriedades farmacocinéticas e toxicológicas distintas e aspectos relevantes para investigações posteriores. Em conjunto, os resultados apontam a strictosidine como o alcaloide de maior consistência global nas condições computacionais investigadas, sem excluir o potencial da reserpine e da vinblastine frente a alvos específicos. Os achados fornecem subsídios para estudos experimentais posteriores destinados à validação do potencial inibitório e antichagásico desses alcaloides.