O feijão-caupi representa uma cultura de grande importância econômico-social no Brasil, especialmente na região Nordeste. Entretanto, sua produção e desenvolvimento podem ser prejudicados pela infecção por diversos patógenos. Dentre eles, o cowpea severe mosaic virus (CPSMV), causador da doença conhecida como mosaico severo do caupi, é um dos mais importantes patógenos responsáveis pela redução da produtividade no feijão-caupi. A ocorrência e distribuição do CPSMV tem sido relatada nas mais diversas regiões produtoras de feijão-caupi no Brasil. Apesar de ter ampla distribuição geográfica, não existem estudos populacionais relacionados a esse patossistema. Considerando a importância da cultura e a relevância e necessidade do conhecimento sobre os fatores evolutivos envolvidos na população desse patógeno, o estudo busca investigar os eventos que constituem e conduzem a estrutura populacional do CPSMV em feijão-caupi. Para isso, estão sendo analisadas sequências específicas (gene MP) de isolados do CPSMV provenientes de amostras de feijão-caupi coletadas em diferentes estados do Brasil. As amostras coletadas são submetidas à extração de RNA e RT-PCR. Em seguida, as amostras são enviadas para sequenciamento e, posteriormente, são realizadas as análises baseadas nas sequências (análise filogenética, análise de recombinação e testes de genética populacional). O conhecimento da estrutura genética de patógenos é importante para a compreensão da história e do potencial evolutivo da espécie, o que auxilia no estabelecimento de estratégias de controle eficientes, além de fornecer dados que podem subsidiar programas de melhoramento genético no desenvolvimento de variedades resistentes