A resistência bacteriana representa um dos maiores desafios da medicina moderna, demandando estratégias inovadoras. Este estudo apresenta o design racional de dois peptídeos sintéticos análogos, WK-MAP1 e WG-MAP2, inspirados na estrutura da enzima papaína (PDB 9PAP), destacando a novidade de utilizar uma enzima como modelo para o desenvolvimento de novos antimicrobianos. Inicialmente, estudos in silico, incluindo modelagem molecular e experimentos de docking, revelaram alta afinidade dos peptídeos por membranas bacterianas miméticas. Subsequentemente, ensaios in vitro confirmaram sua eficácia antimicrobiana. O WK-MAP1 demonstrou atividade superior contra Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenêmicos (KPC+), com uma concentração inibitória mínima (MIC) de 25 µM, enquanto o WG-MAP2 exibiu atividade contra ambas as cepas testadas (KPC+ e ATCC), com MICs de 50 µM e 100 µM, respectivamente. Ambos os peptídeos inibiram eficazmente a formação de biofilmes e apresentaram baixa citotoxicidade em células murinas. Esta pesquisa destaca o potencial de WK-MAP1 e WG-MAP2 como candidatos promissores para novas terapias antimicrobianas, oferecendo uma abordagem inovadora para superar as limitações dos antibióticos convencionais.