O aumento da resistência bacteriana aos antibióticos convencionais tem impulsionado a busca por novos fármacos mais eficazes. Os Peptídeos Antimicrobianos (PAMs) surgem como uma alternativa promissora, com mecanismos de ação distintos dos antibióticos tradicionais. Em particular, pesquisas têm mostrado que os PAMs derivados da papaína, uma proteínase presente no látex de Carica papaya, apresentam atividade antimicrobiana contra diversas bactérias patogênicas. Este estudo teve como objetivo o planejamento de peptídeos antibacterianos análogos à papaína, utilizando modelagem e docking molecular. Os resultados obtidos, especialmente em relação ao análogo 1, revelaram uma maior afinidade e interação com membranas e proteínas de bactérias Gram-negativas, como a Klebsiella pneumoniae. Esses achados apontam para o potencial antimicrobiano significativo desse análogo contra patógenos resistentes. A produção sintética de peptídeos análogos à papaína em laboratório oferece vantagens em termos de controle, disponibilidade e qualidade, em comparação com a obtenção da papaína natural. Essa abordagem possibilita o desenvolvimento de terapias antimicrobianas mais seguras e eficazes, essenciais para combater a resistência bacteriana crescente. Os resultados deste estudo contribuem para a identificação de candidatos a antibióticos inovadores e com potencial impacto na saúde pública e na microbiologia.